Stoksund var født og vokste opp i Stoksund i Herøy kommune. Etter utdanning i Bergen og Ålesund ble han maskinist, og som ung mann seilte han både i innenriks- og utenriksfart. Stoksund var krigsseiler under andre verdenskrig, og har de siste årene møtte han både kongen og forsvarsministeren på krigsseilersamlinger. 

Etter krigen jobbet han på Brand-båtene og på 50-tallet ble han ansatt på Rogaland Sjøguttskole. Her jobbet han som maskinsjef på skoleskipet Gann fram til han ble pensjonist. Johan Stoksund var aktiv i Unge Sjømenns Kristelige Forening, og var inntil nylig på besøk om bord på foreningsmøter.

Vi lyser fred over Johan Nikolai Stokksunds minne. 

(Bildet er fra Johans 103 årsdag, Hvor fire maskinsjefer fra Gann var samlet. Fra venstre: Sven Terje Haugvaldstad, Johan Nikolai Stoksund, Anton Vik, John Helmikstøl)